Kampus UNITEN Putrajaya sebenarnya mula dibentuk pada 1995. Melibatkan tiga peringkat pembangunan dan pembinaan seluas 483 ekar, ia merupakan permulaan usaha untuk memenuhi harapan negara. Kedudukannya yang berdekatan dengan Koridor Raya Multimedia (MSC) dan pusat pentadbiran persekutuan Putrajaya menambah suasana keberuntungan UNITEN. Menurut Dr. Tajul Arus bin Noh, Rektor pertama UNITEN, “Misi utama universiti adalah untuk menyediakan pendidikan dan latihan berkualiti dalam bidang kejuruteraan, teknologi maklumat, perniagaan dan bidang berkaitan untuk rakyat Malaysia dan warganegara lain.” Menjelang tahun 1999, enrolmen pelajar dalam persekitaran pengajaran dan pembelajaran tercanggih ini telah mencapai 5,000 yang mengagumkan. Kira-kira setahun kemudian, pada 29 Jun 2000, Perdana Menteri Malaysia, Tun Dr. Mahathir Mohamad secara rasminya membuka kampus UNITEN Putrajaya. Ini seterusnya mendorong universiti untuk mencapai tahap yang lebih tinggi yang menyaksikan ia bergerak dari kekuatan ke kekuatan mengukuhkan kedudukannya sebagai universiti pilihan. Pada tahun yang sama juga menyaksikan pengambilan pertama pelajar dalam program ijazah sarjana muda UNITEN sendiri.